HOMD ::Genus:Eikenella

Genus: Eikenella

Full Lineage: Bacteria; Pseudomonadota; Betaproteobacteria; Neisseriales; Neisseriaceae; Eikenella Each rank name is a link to abundance plots at that rank:

Lower rank member(s): [Species:Eikenella corrodens] [Species:Eikenella sp. HMT-011]

LINKS: Ecology Home | Life Page: Eikenella

Hide Legend

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

Show Legend

Eren V1-V3 www.pnas.org (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.436	0.363	0.018	0.046	0.023	0.028	0.075	0.087	0.024	0.000
10^thp	0.023	0.029	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.060	0.860	0.054	0.099	0.050	0.074	0.106	0.223	0.052	0.000
Stdev	0.463	0.362	0.044	0.104	0.059	0.046	0.290	0.305	0.073	0.000
Prev(%)	92.208	92.208	29.870	51.948	38.961	51.948	28.571	40.260	25.974	0.000

Eren V3-V5 www.pnas.org (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.296	0.341	0.010	0.036	0.014	0.035	0.023	0.034	0.021	0.000
10^thp	0.027	0.026	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.684	0.822	0.028	0.098	0.042	0.101	0.047	0.060	0.055	0.000
Stdev	0.327	0.309	0.032	0.072	0.023	0.054	0.079	0.113	0.058	0.000
Prev(%)	91.892	91.892	20.946	50.676	42.568	57.432	28.378	41.892	38.514	0.000

Human Microbiome Project 16S RefSeq (V1-V3) (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.582	0.516	0.037	0.081	0.022	0.041	0.067	0.080	0.023	0.000	0.000	0.004	0.013	0.028	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.086	0.038	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.213	1.249	0.086	0.198	0.051	0.113	0.144	0.232	0.051	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.630	0.482	0.109	0.158	0.061	0.069	0.216	0.225	0.079	0.000	0.000	0.038	0.102	0.151	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	96.689	98.013	44.755	63.014	41.611	54.615	41.369	53.333	26.452	0.000	0.000	4.816	4.023	7.834	0.000	0.000	0.000	0.000

Human Microbiome Project 16S RefSeq (V3-V5) (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.561	0.558	0.000	0.160	0.058	0.000	0.116	0.109	0.000	0.000	0.054	0.064	0.127	0.167	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.083	0.059	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.159	1.182	0.000	0.363	0.161	0.000	0.316	0.304	0.000	0.000	0.076	0.058	0.328	0.587	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.531	0.599	0.000	0.411	0.128	0.000	0.310	0.484	0.000	0.000	0.236	0.357	0.399	0.474	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	97.284	95.854	0.000	58.561	43.223	0.000	45.483	52.068	0.000	0.000	21.656	17.901	31.724	33.333	0.000	0.000	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.343	0.248	0.015	0.024	0.053	0.019	0.017	0.008	0.009	0.000
10^thp	0.000	0.004	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.168	0.634	0.046	0.046	0.156	0.051	0.044	0.007	0.038	0.000
Stdev	0.584	0.312	0.023	0.035	0.132	0.029	0.032	0.021	0.018	0.001
Prev(%)	87.838	97.059	67.442	80.000	71.429	76.000	57.576	41.935	50.000	10.000

Human Microbiome Project Metaphlan (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.375	0.326	0.147	0.030	0.031	0.000	0.015	0.028	0.042	0.014	0.000	0.000	0.001	0.000	0.000	0.018	0.000	0.000
10^thp	0.102	0.040	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.714	0.730	0.490	0.004	0.070	0.000	0.048	0.115	0.152	0.030	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.256	0.311	0.217	0.121	0.124	0.000	0.032	0.070	0.080	0.052	0.000	0.000	0.004	0.000	0.000	0.067	0.000	0.000
Prev(%)	95.833	95.455	58.333	11.765	21.809	0.000	25.000	18.750	28.000	18.545	0.000	0.000	3.125	0.000	0.000	7.143	0.000	0.000

Copyright 2007-2025, The Forsyth Institute
Hosted on Amazon AWS EC2

Body Site Legend: