HOMD ::Species:Leptotrichia hongkongensis

Species: Leptotrichia hongkongensis (HMT-213)

Full Lineage: Bacteria; Fusobacteriota; Fusobacteriia; Fusobacteriales; Leptotrichiaceae; Leptotrichia; Leptotrichia hongkongensis Each rank name is a link to abundance plots at that rank:

LINKS: Ecology Home | HMT-213: Body Sites Data | HMT-213: Taxon Description | Life Page: Leptotrichia hongkongensis

Hide Legend

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

Show Legend

Eren V1-V3 www.pnas.org (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.258	0.585	0.037	0.118	0.015	0.056	0.013	0.008	0.007	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.741	1.567	0.067	0.235	0.036	0.143	0.032	0.026	0.028	0.000
Stdev	0.462	1.213	0.174	0.424	0.049	0.119	0.047	0.022	0.020	0.000
Prev(%)	64.935	72.727	23.377	51.948	25.974	44.156	20.779	19.481	20.779	0.000

Eren V3-V5 www.pnas.org (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.376	0.722	0.018	0.097	0.041	0.092	0.025	0.026	0.011	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.205	1.743	0.035	0.272	0.069	0.253	0.060	0.051	0.039	0.000
Stdev	0.655	1.531	0.081	0.211	0.188	0.167	0.089	0.074	0.025	0.000
Prev(%)	66.216	78.378	19.595	56.757	36.486	55.405	25.000	30.405	29.730	0.000

Human Microbiome Project 16S RefSeq (V1-V3) (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.409	0.778	0.067	0.176	0.041	0.065	0.033	0.017	0.000	0.006	0.012	0.004	0.022	0.027	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.027	1.781	0.145	0.350	0.055	0.146	0.030	0.042	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	1.071	1.670	0.204	0.584	0.206	0.143	0.274	0.042	0.000	0.040	0.137	0.027	0.127	0.182	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	73.510	84.768	34.266	62.329	34.899	50.000	26.190	38.000	0.000	7.000	6.322	4.249	9.195	6.452	0.000	0.000	0.000	0.000

Human Microbiome Project 16S RefSeq (V3-V5) (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.565	0.933	0.110	0.250	0.066	0.128	0.081	0.168	0.000	0.000	0.000	0.026	0.046	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.556	2.417	0.221	0.585	0.144	0.353	0.088	0.260	0.000	0.000	0.000	0.010	0.071	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	1.061	1.652	0.620	0.599	0.295	0.250	0.564	0.727	0.000	0.000	0.000	0.206	0.214	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	76.049	81.707	32.840	64.516	35.294	61.905	30.218	55.474	0.000	0.000	0.000	10.802	16.552	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.573	0.634	0.026	0.149	0.148	0.009	0.047	0.053	0.011	0.001
10^thp	0.000	0.017	0.000	0.000	0.005	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.161	1.513	0.071	0.459	0.271	0.025	0.133	0.068	0.024	0.000
Stdev	1.805	1.157	0.052	0.253	0.343	0.017	0.120	0.207	0.026	0.003
Prev(%)	85.135	97.059	67.442	85.714	92.857	58.000	75.758	58.065	62.500	5.000

Human Microbiome Project Metaphlan (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.450	0.298	0.254	0.041	0.076	0.000	0.051	0.000	0.001	0.003	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.157	0.001	0.001
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.048	0.795	0.227	0.090	0.160	0.000	0.129	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	1.257	0.542	0.992	0.118	0.439	0.000	0.099	0.000	0.004	0.010	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.588	0.006	0.031
Prev(%)	62.500	74.495	45.833	29.412	29.521	0.000	50.000	0.000	4.000	9.859	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	7.143	1.010	0.364

Copyright 2007-2025, The Forsyth Institute
Hosted on Amazon AWS EC2

Body Site Legend: