HOMD ::Species:Haemophilus sputorum

Species: Haemophilus sputorum (HMT-944)

Full Lineage: Bacteria; Pseudomonadota; Gammaproteobacteria; Pasteurellales; Pasteurellaceae; Haemophilus; Haemophilus sputorum Each rank name is a link to abundance plots at that rank:

LINKS: Ecology Home | HMT-944: Body Sites Data | HMT-944: Taxon Description | Life Page: Haemophilus sputorum

Hide Legend

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

Show Legend

HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.028	0.074	0.025	0.000	0.046	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.031	0.070	0.045	0.000	0.078	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.000	0.000	0.156	0.381	0.080	0.000	0.171	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	0.000	0.000	23.077	35.616	26.174	0.000	34.821	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.180	0.637	0.278	0.344	0.292	0.314	0.058	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.379	1.748	0.852	0.986	0.573	0.851	0.164	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.000	0.000	0.638	1.160	0.479	0.580	0.951	0.733	0.140	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	0.000	0.000	44.691	73.201	62.660	71.131	56.075	69.100	48.418	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.009	0.012	0.171	0.290	0.064	0.116	0.053	0.148	0.061	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.004	0.004	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.010	0.010	0.643	0.859	0.148	0.137	0.199	0.649	0.121	0.000
Stdev	0.040	0.054	0.307	0.649	0.090	0.320	0.075	0.311	0.191	0.000
Prev(%)	41.892	50.000	93.023	91.429	78.571	72.000	72.727	74.194	57.500	0.000

HMP Metaphlan (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.005	0.009	0.000	0.021	0.234	0.050	0.532	0.047	0.131	0.033	0.001	0.001	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.050	0.021	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.010	0.000	0.066	0.710	0.050	1.110	0.065	0.346	0.085	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.027	0.074	0.000	0.051	0.488	0.000	0.509	0.152	0.328	0.092	0.006	0.006	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.003
Prev(%)	4.167	10.354	0.000	23.529	58.245	100.000	87.500	25.000	44.000	44.131	1.351	4.167	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.909

Eren V1-V3 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.001	0.003	0.016	0.054	0.018	0.040	0.018	0.022	0.010	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.018	0.064	0.031	0.061	0.053	0.047	0.031	0.000
Stdev	0.008	0.014	0.106	0.271	0.062	0.165	0.058	0.066	0.028	0.000
Prev(%)	2.597	6.494	12.987	29.870	19.481	16.883	20.779	24.675	15.584	0.000

Eren V3-V5 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.005	0.005	0.036	0.166	0.072	0.144	0.101	0.170	0.024	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.020	0.025	0.086	0.531	0.195	0.380	0.218	0.366	0.068	0.000
Stdev	0.016	0.015	0.098	0.277	0.130	0.254	0.222	0.506	0.065	0.003
Prev(%)	14.189	12.162	35.135	68.243	55.405	66.892	49.324	62.162	33.108	1.399

Copyright 2007-2025, The Forsyth Institute
Hosted on Amazon AWS EC2

Body Site Legend: