HOMD ::Species:Eggerthella lenta

Taxonomy: V4.1 | 16S rRNA RefSeq: V16.03 | Genomic RefSeq: V11.02 | Viruses: V1.2

Species: Eggerthella lenta (HMT-654)

Download Options

Full Lineage: Bacteria; Actinomycetota; Coriobacteriia; Eggerthellales; Eggerthellaceae; Eggerthella; Eggerthella lenta Each rank name is a link to abundance plots at that rank:

LINKS: Ecology Home | HMT-654: Body Sites Data | HMT-654: Taxon Description | Life Page: Eggerthella lenta

Hide Legend

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.021	0.006	0.010	0.047	0.073	0.000	0.000	0.000	0.637
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	1.816
Stdev	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.332	0.092	0.096	0.400	0.469	0.000	0.000	0.000	1.324
Prev(%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	4.000	3.736	4.249	6.897	6.912	0.000	0.000	0.000	68.627

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.031	0.034	0.000	0.000	0.011	0.004	0.000	0.000	0.000	0.082	0.040	0.000	0.000	0.000	1.358
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.004	0.000	0.000	0.000	0.000	4.355
Stdev	0.000	0.000	0.000	0.537	0.535	0.000	0.000	0.133	0.076	0.000	0.000	0.000	0.335	0.220	0.000	0.000	0.000	2.885
Prev(%)	0.000	0.000	0.000	4.218	6.394	0.000	0.000	3.893	1.946	0.000	0.000	0.000	10.345	6.667	0.000	0.000	0.000	68.613

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

HMP Metaphlan (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.008
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.020
Stdev	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.026
Prev(%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	16.545

Eren V1-V3 www.pnas.org

No Notes

Eren V3-V5 www.pnas.org

No Notes