HOMD ::order::Pseudomonadales

Order: Pseudomonadales

Each rank name is a link to abundance plots at that rank:
Full Lineage: Bacteria; Pseudomonadota; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales
Lower rank member(s): [Family:Moraxellaceae] [Family:Pseudomonadaceae]
Genera:

LINKS: Ecology Home | Life Page: Pseudomonadales

Oral:	SUBP-- Subgingival Plaque	SUPP -- Supragingival Plaque	PERIO -- Periodontal	AKE -- Attached Keratinized Gingiva	BMU -- Buccal Mucosa
Oral:	HPA -- Hard Palate	SAL -- Saliva	THR -- Throat	PTO -- Palatine Tonsils	TDO -- Tongue Dorsum
Nasal:	ANA -- Anterior Nares
Skin:	LRC -- L_Retroauricular Crease	RRC -- R_Retroauricular Crease	LAF -- L_Antecubital Fossa	RAF -- R_Antecubital Fossa
Vaginal:	VIN -- Vaginal Introitus	MVA -- Mid Vagina	PFO -- Posterior Fornix
Gut:	STO -- Stool

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.034	0.000	0.041	0.466	0.000	0.000	1.160	0.038	0.043	0.574	0.341	0.282	0.159	0.054	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	1.011	0.047	0.056	1.240	0.740	0.841	0.555	0.154	0.000
Stdev	0.000	0.000	0.000	0.389	0.000	0.345	3.759	0.000	0.000	5.659	0.264	0.198	1.855	0.888	0.680	0.408	0.169	0.000
Prev(%)	0.000	0.000	0.000	4.795	0.000	1.538	9.524	0.000	0.000	43.333	28.161	31.445	75.287	64.516	40.845	37.838	26.316	0.000

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.028	0.033	0.039	0.000	0.049	0.065	1.189	0.000	0.005	4.142	0.598	0.409	1.409	2.262	0.000	0.000	0.000	0.006
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.061	0.009	0.225	0.000	0.000	8.629	0.639	0.484	3.004	3.990	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.343	0.397	0.372	0.000	0.267	0.580	7.728	0.000	0.072	13.563	4.238	2.121	3.710	7.363	0.000	0.000	0.000	0.112
Prev(%)	2.469	2.195	8.395	0.000	16.368	10.417	24.611	0.000	0.730	68.199	52.866	53.086	77.931	76.667	0.000	0.000	0.000	0.487

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.001	0.000	0.001	0.001	0.002	0.001	0.000	0.095	0.000	0.256
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.001	0.002	0.009	0.004	0.003	0.003	0.000	0.245
Stdev	0.004	0.000	0.003	0.001	0.006	0.002	0.001	0.527	0.000	0.787
Prev(%)	8.108	0.000	11.628	25.714	17.857	14.000	15.152	16.129	0.000	25.000

HMP Metaphlan (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.042	0.034	0.000	0.124	0.000	0.018	0.000	0.000	0.007	6.414	0.013	0.022	2.460	0.361	0.160	0.064	0.058
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	2.460	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.027	0.000	0.000	0.000	0.042	0.000	0.000	0.000	17.391	0.034	0.078	2.460	0.630	0.344	0.030	0.000
Stdev	0.000	0.821	0.130	0.000	2.331	0.000	0.049	0.000	0.000	0.145	18.022	0.036	0.057	0.000	0.896	0.453	0.375	0.919
Prev(%)	0.000	1.010	16.667	0.000	1.862	0.000	12.500	0.000	0.000	0.235	27.928	29.167	21.875	100.000	36.364	21.429	11.616	2.000

Eren V1-V3 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.025	0.200	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.216	1.557	0.003	0.000	0.000
Prev(%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	1.299	6.494	1.299	0.000	0.000

Eren V3-V5 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.001	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.756	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.018	0.000	0.000	0.000	0.000	0.003	6.237	0.002	0.000	0.000
Prev(%)	0.676	0.000	0.000	0.000	0.000	0.676	4.730	1.351	0.000	0.000

Copyright 2007-2025, The Forsyth Institute
Hosted on Amazon AWS EC2