HOMD ::order::Enterobacterales

Order: Enterobacterales

Each rank name is a link to abundance plots at that rank:
Full Lineage: Bacteria; Pseudomonadota; Gammaproteobacteria; Enterobacterales
Lower rank member(s): [Family:Enterobacteriaceae] [Family:Morganellaceae] [Family:Yersiniaceae]
Genera:

LINKS: Ecology Home | Life Page: Enterobacterales

Oral:	SUBP-- Subgingival Plaque	SUPP -- Supragingival Plaque	PERIO -- Periodontal	AKE -- Attached Keratinized Gingiva	BMU -- Buccal Mucosa
Oral:	HPA -- Hard Palate	SAL -- Saliva	THR -- Throat	PTO -- Palatine Tonsils	TDO -- Tongue Dorsum
Nasal:	ANA -- Anterior Nares
Skin:	LRC -- L_Retroauricular Crease	RRC -- R_Retroauricular Crease	LAF -- L_Antecubital Fossa	RAF -- R_Antecubital Fossa
Vaginal:	VIN -- Vaginal Introitus	MVA -- Mid Vagina	PFO -- Posterior Fornix
Gut:	STO -- Stool

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.030	0.033	0.104	0.000	0.000	0.157	0.025	0.034	0.217	0.116	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.017	0.000	0.000	0.000	0.359	0.000	0.000	0.187	0.154	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.000	0.000	0.000	0.000	0.275	0.270	1.865	0.000	0.000	0.587	0.262	0.368	1.571	0.660	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	0.000	0.000	0.000	0.000	8.054	13.077	3.274	0.000	0.000	35.000	8.908	7.082	36.207	39.171	0.000	0.000	0.000	0.000

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.013	0.018	0.038	0.000	0.076	0.000	0.371	0.000	0.012	1.216	0.246	0.349	1.153	1.289	0.000	0.005	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.048	0.000	0.044	0.000	0.000	2.531	0.273	0.392	2.118	2.898	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.121	0.264	0.244	0.000	0.553	0.000	4.596	0.000	0.137	3.689	2.387	3.123	3.919	4.173	0.000	0.040	0.000	0.000
Prev(%)	5.432	3.902	8.889	0.000	15.345	0.000	15.265	0.000	3.163	59.004	39.490	40.741	66.207	72.667	0.000	4.918	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.001	0.001	0.000	0.001	0.001	0.000	0.000	0.035	0.000	0.068
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.001	0.001	0.000	0.000	0.000	0.000	0.078
Stdev	0.004	0.005	0.001	0.002	0.002	0.000	0.001	0.192	0.000	0.263
Prev(%)	9.459	8.824	6.977	14.286	10.714	4.000	3.030	9.677	2.500	15.000

HMP Metaphlan (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.080	0.001	0.000	0.021	0.003	0.000	0.057	4.748	0.041	0.037	0.797	0.000	0.000	12.490	0.005	0.539	0.156	0.210
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	12.490	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.119	0.000	0.000	0.092	0.000	0.000	0.158	8.720	0.094	0.000	0.160	0.000	0.000	12.490	0.020	0.409	0.003	0.111
Stdev	0.264	0.015	0.000	0.044	0.022	0.000	0.144	14.662	0.120	0.736	6.625	0.000	0.000	0.000	0.013	1.802	1.012	4.071
Prev(%)	29.167	2.273	0.000	23.529	3.191	0.000	25.000	37.500	28.000	2.582	14.865	0.000	0.000	100.000	18.182	42.857	10.101	28.364

Eren V1-V3 www.pnas.org

No Notes

Eren V3-V5 www.pnas.org

No Notes

Copyright 2007-2025, The Forsyth Institute
Hosted on Amazon AWS EC2