HOMD ::genus::Ruminococcaceae [G1]

Genus: Ruminococcaceae [G1]

Each rank name is a link to abundance plots at that rank:
Full Lineage: Bacteria; Bacillota; Clostridia; Eubacteriales; Ruminococcaceae; Ruminococcaceae [G1]
Lower rank member(s): [Species:Ruminococcaceae [G1] bacterium HMT-075]

LINKS: Ecology Home | Life Page: Ruminococcaceae [G1]

Oral:	SUBP-- Subgingival Plaque	SUPP -- Supragingival Plaque	PERIO -- Periodontal	AKE -- Attached Keratinized Gingiva	BMU -- Buccal Mucosa
Oral:	HPA -- Hard Palate	SAL -- Saliva	THR -- Throat	PTO -- Palatine Tonsils	TDO -- Tongue Dorsum
Nasal:	ANA -- Anterior Nares
Skin:	LRC -- L_Retroauricular Crease	RRC -- R_Retroauricular Crease	LAF -- L_Antecubital Fossa	RAF -- R_Antecubital Fossa
Vaginal:	VIN -- Vaginal Introitus	MVA -- Mid Vagina	PFO -- Posterior Fornix
Gut:	STO -- Stool

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.077	0.040	0.000	0.016	0.039	1.344	0.173	0.127	0.119	0.000	0.002	0.000	0.000	0.008	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.154	0.103	0.000	0.038	0.109	3.582	0.498	0.284	0.155	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.291	0.126	0.000	0.048	0.091	2.433	0.417	0.336	0.704	0.000	0.033	0.000	0.000	0.063	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	36.424	30.464	0.000	27.397	39.597	81.538	52.381	59.333	43.226	0.000	3.161	0.000	0.000	2.765	0.000	0.000	0.000	0.000

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.071	0.070	0.000	0.051	0.096	2.306	0.255	0.234	0.120	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.205	0.176	0.000	0.163	0.269	7.210	0.764	0.626	0.332	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.181	0.221	0.000	0.139	0.225	4.224	0.569	0.573	0.384	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	40.741	39.512	0.000	33.995	43.990	86.310	52.648	57.664	47.202	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.118	0.033	0.061	0.031	0.024	0.042	0.197	0.123	0.027	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.088	0.102	0.063	0.076	0.072	0.115	0.384	0.175	0.086	0.000
Stdev	0.786	0.054	0.251	0.088	0.051	0.086	0.463	0.403	0.050	0.000
Prev(%)	47.297	50.000	51.163	62.857	42.857	66.000	75.758	70.968	65.000	0.000

HMP Metaphlan (not published)

No Notes

Eren V1-V3 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.083	0.099	0.003	0.018	0.050	2.217	0.288	0.220	0.116	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.204	0.289	0.000	0.044	0.107	6.795	0.569	0.417	0.226	0.000
Stdev	0.217	0.247	0.012	0.044	0.110	3.884	0.940	0.818	0.400	0.000
Prev(%)	36.364	36.364	9.091	28.571	46.753	81.818	51.948	54.545	41.558	0.000

Eren V3-V5 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.064	0.084	0.002	0.030	0.068	1.593	0.211	0.149	0.104	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.220	0.220	0.000	0.089	0.157	3.847	0.538	0.522	0.224	0.000
Stdev	0.140	0.233	0.009	0.084	0.185	3.345	0.479	0.355	0.342	0.001
Prev(%)	35.811	39.189	4.730	34.459	44.595	85.135	64.189	51.351	39.189	0.699

Copyright 2007-2025, The Forsyth Institute
Hosted on Amazon AWS EC2