HOMD ::genus::Mogibacterium

HOME
Taxonomy
Genomes
Proteomes
16S rRNA Microbiome
Animal Microbiomes
- Mouse (MOMD)
Downloads
- Download Batch HOMD Data
- HOMD FTP Site
Resources/Tools
About Us

Taxonomy: V4.0 | 16S rRNA RefSeq: V16.01 | Genomic RefSeq: V11.01

Genus: Mogibacterium

Download Options

Each rank name is a link to abundance plots at that rank:
Full Lineage: Bacteria; Bacillota; Clostridia; Peptostreptococcales; Anaerovoracaceae; Mogibacterium
Lower rank member(s): [Species:Mogibacterium diversum] [Species:Mogibacterium neglectum] [Species:Mogibacterium pumilum] [Species:Mogibacterium timidum] [Species:Mogibacterium vescum]

LINKS: Ecology Home | Life Page: Mogibacterium

Oral:	SUBP-- Subgingival Plaque	SUPP -- Supragingival Plaque	PERIO -- Periodontal	AKE -- Attached Keratinized Gingiva	BMU -- Buccal Mucosa
Oral:	HPA -- Hard Palate	SAL -- Saliva	THR -- Throat	PTO -- Palatine Tonsils	TDO -- Tongue Dorsum
Nasal:	ANA -- Anterior Nares
Skin:	LRC -- L_Retroauricular Crease	RRC -- R_Retroauricular Crease	LAF -- L_Antecubital Fossa	RAF -- R_Antecubital Fossa
Vaginal:	VIN -- Vaginal Introitus	MVA -- Mid Vagina	PFO -- Posterior Fornix
Gut:	STO -- Stool

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.027	0.000	0.007	0.021	0.186	0.139	0.227	0.185	0.216	0.000	0.000	0.000	0.010	0.003	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.012	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.065	0.000	0.020	0.056	0.493	0.359	0.538	0.387	0.529	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.062	0.000	0.020	0.040	0.213	0.212	0.300	0.197	0.221	0.000	0.000	0.000	0.065	0.015	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	47.682	0.000	19.580	45.205	78.523	70.000	84.226	90.667	87.742	0.000	0.000	0.000	5.172	5.069	0.000	0.000	0.000	0.000

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.037	0.000	0.000	0.042	0.273	0.154	0.259	0.189	0.226	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.105	0.000	0.000	0.152	0.697	0.355	0.613	0.426	0.514	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.094	0.000	0.000	0.086	0.312	0.193	0.283	0.191	0.230	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	46.667	0.000	0.000	37.469	77.238	80.952	80.374	86.131	88.808	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.341	0.034	0.054	0.103	0.193	0.274	0.414	0.487	0.286	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.013	0.024	0.017	0.002	0.000
90^thp	1.063	0.074	0.185	0.312	0.470	0.585	0.932	1.327	0.974	0.000
Stdev	0.705	0.070	0.096	0.172	0.281	0.483	0.428	0.561	0.376	0.000
Prev(%)	82.432	79.412	65.116	85.714	85.714	98.000	100.000	100.000	92.500	0.000

HMP Metaphlan (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.070	0.006	0.278	0.014	0.034	0.100	0.246	0.289	0.330	0.520	0.003	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.003	0.007
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.100	0.034	0.000	0.000	0.030	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.114	0.010	0.607	0.040	0.100	0.100	0.477	0.790	0.868	1.115	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.227	0.031	0.485	0.039	0.085	0.000	0.257	0.371	0.322	0.449	0.037	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.044	0.050
Prev(%)	25.000	11.364	70.833	17.647	32.979	100.000	100.000	75.000	84.000	93.192	0.901	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.505	7.455

Eren V1-V3 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.041	0.013	0.005	0.034	0.205	0.177	0.277	0.246	0.272	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.109	0.029	0.005	0.107	0.503	0.554	0.588	0.610	0.771	0.000
Stdev	0.106	0.037	0.017	0.053	0.273	0.236	0.292	0.351	0.310	0.000
Prev(%)	32.468	19.481	10.390	48.052	84.416	74.026	84.416	81.818	84.416	0.000

Eren V3-V5 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.016	0.004	0.003	0.012	0.084	0.071	0.105	0.067	0.078	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.042	0.013	0.000	0.031	0.228	0.145	0.294	0.176	0.216	0.000
Stdev	0.048	0.015	0.011	0.039	0.130	0.152	0.141	0.091	0.119	0.000
Prev(%)	24.324	11.486	7.432	20.946	61.486	58.108	64.865	60.811	54.730	0.000