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Taxonomy: V4.0   |  16S rRNA RefSeq: V16.01   |  Genomic RefSeq: V11.01
Genus: Hallella
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Oral:
SUBP-- Subgingival Plaque SUPP -- Supragingival Plaque PERIO -- Periodontal AKE -- Attached Keratinized Gingiva BMU -- Buccal Mucosa
HPA -- Hard Palate SAL -- Saliva THR -- Throat PTO -- Palatine Tonsils TDO -- Tongue Dorsum
Nasal:
ANA -- Anterior Nares
Skin:
LRC -- L_Retroauricular Crease RRC -- R_Retroauricular Crease LAF -- L_Antecubital Fossa RAF -- R_Antecubital Fossa
Vaginal:
VIN -- Vaginal Introitus MVA -- Mid Vagina PFO -- Posterior Fornix
Gut:
STO -- Stool
Oral:
SUBP-- Subgingival Plaque
SUPP -- Supragingival Plaque
PERIO -- Periodontal
AKE -- Attached Keratinized Gingiva
BMU -- Buccal Mucosa
HPA -- Hard Palate
SAL -- Saliva
THR -- Throat
PTO -- Palatine Tonsils
TDO -- Tongue Dorsum
Nasal:
ANA -- Anterior Nares
Skin:
LRC -- L_Retroauricular Crease
RRC -- R_Retroauricular Crease
LAF -- L_Antecubital Fossa
RAF -- R_Antecubital Fossa
Vaginal:
VIN -- Vaginal Introitus
MVA -- Mid Vagina
PFO -- Posterior Fornix
Gut:
STO -- Stool

Prev - Prevalence
10thp - 10th percentile
90thp - 90th percentile
ND - less than 0.001%
HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)
No Notes
SUBPSUPPAKEBMUHPASALTHRPTOTDOANALRCRRCLAFRAFVINMVAPFOSTO
Avg (%)0.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0050.0070.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
10thp0.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
90thp0.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
Stdev0.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0610.0720.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
Prev(%)0.0000.0000.0000.0000.0000.0002.6794.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)
No Notes
SUBPSUPPAKEBMUHPASALTHRPTOTDOANALRCRRCLAFRAFVINMVAPFOSTO
Avg (%)0.0000.0000.0000.0000.0000.0410.0410.0090.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
10thp0.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
90thp0.0000.0000.0000.0000.0000.1290.0900.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
Stdev0.0000.0000.0000.0000.0000.1000.1870.0630.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
Prev(%)0.0000.0000.0000.0000.00036.31022.4307.5430.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000

Dewhirst (35x9) (not published)
No Notes
SUBPSUPPAKEBMUHPASALTHRPTOTDOANA
Avg (%)0.0170.0030.0020.0200.0060.0080.0070.0490.0010.000
10thp0.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
90thp0.0380.0120.0090.0220.0120.0220.0260.0910.0040.000
Stdev0.0490.0080.0050.0870.0170.0150.0110.1670.0040.000
Prev(%)41.89226.47130.23337.14332.14338.00054.54538.71015.0000.000

HMP Metaphlan (not published)
No Notes
SUBPSUPPPERIOAKEBMUHPASALTHRPTOTDOANALRCRRCRAFVINMVAPFOSTO
Avg (%)0.0060.0000.1270.0000.0010.0000.0050.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
10thp0.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
90thp0.0000.0000.4240.0000.0000.0000.0200.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
Stdev0.0200.0070.3260.0000.0190.0000.0090.0000.0000.0010.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000
Prev(%)8.3330.50533.3330.0000.7980.00025.0000.0000.0000.4690.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000

Eren V1-V3 www.pnas.org
No Notes

Eren V3-V5 www.pnas.org
No Notes