HOMD ::Genus:Gallibacter

Genus: Gallibacter

Full Lineage: Bacteria; Bacillota; Clostridia; Peptostreptococcales; Anaerovoracaceae; Gallibacter Each rank name is a link to abundance plots at that rank:

Lower rank member(s): [Species:Gallibacter brachus]

LINKS: Ecology Home | Life Page: Gallibacter

Hide Legend

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

Show Legend

HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.113	0.017	0.000	0.008	0.000	0.007	0.046	0.123	0.000	0.000	0.001	0.000	0.027	0.012	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.334	0.047	0.000	0.014	0.000	0.028	0.076	0.276	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.191	0.035	0.000	0.036	0.000	0.018	0.212	0.430	0.000	0.000	0.012	0.000	0.229	0.113	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	61.589	38.411	0.000	18.493	0.000	20.769	25.298	42.000	0.000	0.000	2.299	0.000	3.448	2.765	0.000	0.000	0.000	0.000

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.160	0.031	0.000	0.000	0.000	0.000	0.076	0.199	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.458	0.088	0.000	0.000	0.000	0.000	0.126	0.590	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.251	0.098	0.000	0.000	0.000	0.000	0.293	0.488	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	67.654	35.854	0.000	0.000	0.000	0.000	30.841	48.905	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.517	0.088	0.012	0.055	0.028	0.022	0.049	0.229	0.002	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.319	0.155	0.034	0.143	0.089	0.051	0.105	0.758	0.007	0.000
Stdev	1.130	0.203	0.030	0.127	0.064	0.053	0.139	0.614	0.004	0.000
Prev(%)	72.973	64.706	41.860	60.000	50.000	56.000	60.606	67.742	25.000	0.000

HMP Metaphlan (not published)

No Notes

Eren V1-V3 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.110	0.020	0.005	0.012	0.006	0.004	0.058	0.125	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.427	0.056	0.000	0.026	0.022	0.017	0.051	0.291	0.000	0.000
Stdev	0.188	0.044	0.036	0.043	0.016	0.014	0.366	0.509	0.003	0.000
Prev(%)	49.351	31.169	3.896	22.078	19.481	11.688	23.377	35.065	2.597	0.000

Eren V3-V5 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.163	0.039	0.004	0.014	0.012	0.014	0.048	0.117	0.003	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.407	0.099	0.000	0.047	0.048	0.048	0.064	0.188	0.002	0.000
Stdev	0.243	0.110	0.031	0.035	0.031	0.052	0.255	0.441	0.009	0.000
Prev(%)	68.243	35.135	2.703	22.297	21.622	20.270	29.730	34.459	10.135	0.000

Copyright 2007-2025, The Forsyth Institute
Hosted on Amazon AWS EC2

Body Site Legend: