HOMD ::family::Comamonadaceae

Family: Comamonadaceae

Each rank name is a link to abundance plots at that rank:
Full Lineage: Bacteria; Pseudomonadota; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Comamonadaceae
Lower rank member(s): show[+]

LINKS: Ecology Home | Life Page: Comamonadaceae

Oral:	SUBP-- Subgingival Plaque	SUPP -- Supragingival Plaque	PERIO -- Periodontal	AKE -- Attached Keratinized Gingiva	BMU -- Buccal Mucosa
Oral:	HPA -- Hard Palate	SAL -- Saliva	THR -- Throat	PTO -- Palatine Tonsils	TDO -- Tongue Dorsum
Nasal:	ANA -- Anterior Nares
Skin:	LRC -- L_Retroauricular Crease	RRC -- R_Retroauricular Crease	LAF -- L_Antecubital Fossa	RAF -- R_Antecubital Fossa
Vaginal:	VIN -- Vaginal Introitus	MVA -- Mid Vagina	PFO -- Posterior Fornix
Gut:	STO -- Stool

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.267	0.185	0.038	0.067	0.044	0.039	0.072	0.008	0.000	3.005	0.145	0.209	0.872	0.636	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.567	0.387	0.043	0.150	0.018	0.034	0.165	0.009	0.000	9.993	0.303	0.299	2.459	1.531	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.734	0.672	0.223	0.308	0.395	0.159	0.227	0.052	0.000	7.129	0.544	1.253	1.821	1.765	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	50.993	52.318	20.979	39.726	15.436	20.769	39.583	15.333	0.000	69.333	49.425	57.507	67.241	63.594	0.000	0.000	0.000	0.000

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.242	0.215	0.152	0.000	0.121	0.000	0.129	0.015	0.000	0.000	0.248	0.225	0.455	0.708	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.753	0.539	0.000	0.000	0.111	0.000	0.075	0.000	0.000	0.000	0.270	0.144	1.052	1.043	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.647	0.657	2.544	0.000	1.193	0.000	1.339	0.152	0.000	0.000	1.211	1.924	1.466	2.817	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	41.481	47.805	3.210	0.000	24.808	0.000	17.445	6.813	0.000	0.000	50.000	29.630	60.000	64.667	0.000	0.000	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.162	0.161	0.001	0.001	0.002	0.002	0.001	0.023	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.214	0.440	0.003	0.006	0.004	0.004	0.003	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.577	0.372	0.004	0.003	0.007	0.005	0.002	0.128	0.000	0.000
Prev(%)	37.838	58.824	16.279	20.000	21.429	20.000	21.212	9.677	2.500	0.000

HMP Metaphlan (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.070	0.240	0.351	0.005	0.027	0.000	0.000	0.000	0.001	0.007	0.029	0.005	0.005	0.380	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.380	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.231	0.620	0.923	0.024	0.015	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.017	0.010	0.380	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.120	0.843	1.126	0.012	0.146	0.000	0.000	0.000	0.004	0.104	0.193	0.015	0.015	0.000	0.000	0.000	0.001	0.001
Prev(%)	54.167	41.919	20.833	17.647	10.638	0.000	0.000	0.000	4.000	2.347	4.955	16.667	15.625	100.000	0.000	0.000	0.505	0.364

Eren V1-V3 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.099	0.048	0.000	0.014	0.001	0.004	0.000	0.001	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.110	0.042	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.422	0.250	0.002	0.069	0.006	0.025	0.000	0.011	0.000	0.000
Prev(%)	18.182	15.584	1.299	7.792	2.597	3.896	0.000	1.299	0.000	0.000

Eren V3-V5 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.312	0.201	0.001	0.035	0.046	0.011	0.150	0.002	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.428	0.434	0.000	0.031	0.049	0.053	0.040	0.000	0.000	0.000
Stdev	1.782	0.611	0.006	0.261	0.329	0.031	1.213	0.008	0.002	0.002
Prev(%)	34.459	36.486	2.027	16.892	23.649	15.541	16.216	7.432	0.676	0.699

[Genus:Acidovorax]	[Genus:Comamonas]	[Genus:Delftia]	[Genus:Leptothrix]	[Genus:Ottowia]
[Genus:Paenacidovorax]	[Genus:Schlegelella]	[Genus:Variovorax]

Copyright 2007-2025, The Forsyth Institute
Hosted on Amazon AWS EC2