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Taxonomy: V4.2   |  16S rRNA RefSeq: V16.03   |  Genomic RefSeq: V11.02   |  Viruses: V1.2

HOMD Pangenomes


Description
Pangenomes summarize gene content diversity across oral microbial taxa. By default, they are defined at the Human Microbial Taxon (HMT) level with genomes as rows and gene clusters as columns; black marks indicate gene cluster presence. Interactive views and downloadable files support comparative genomics, functional exploration, and reuse. Pangenomes are built from HOMD V4.1 genomes (Genomes V11.02) using anvio v8. Functional annotations include KEGG KOfams, NCBI COGs, and Pfam. Built: 2025-12-08. Anvi`o (https://anvio.org) is a visualization platform for microbial 'omics and is used here to display the HOMD pangenomes.
Search Names: Reload Page
Available Pangenomes Count: 579 Created with HOMD Genomic Version `11.02`
Pangenome
   Click to Sort		 Interactive Preview Scope Genome
Count
Abiotrophia_defectiva_homd_HMT_389 OpenAnvi`o OpenSVG HMT-389 5 ( id-list
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