CRISPRs Research

Number of CRISPRs candidates = 10
Confirmed CRISPRs = 5	Questionable CRISPRs = 5
TDC60_Crispr_4 TDC60_Crispr_5 TDC60_Crispr_6 TDC60_Crispr_7 TDC60_Crispr_9	TDC60_PossibleCrispr_1 TDC60_PossibleCrispr_2 TDC60_PossibleCrispr_3 TDC60_PossibleCrispr_8 TDC60_PossibleCrispr_10
CRISPRs candidates localization

CRISPR id : tmp_1_Crispr_5

CRISPR start position : 293621 ---------- CRISPR end position : 294703 ---------- CRISPR length : 1082
DR consensus : GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
DR length : 30 Number of spacers : 16

293621	ATTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GGGGATGAGCGGCGATGGCTTAATCGGGCGTCTGTT	293686
293687	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTGCATACCGACCTCTTCCAACGAGCCTGCATCGCTC	293753
293754	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTCCAGCCTGCAGACGACAAAGCAGGCGCCTCGAAGG	293820
293821	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GGCGTACCCCCTATGACAGCTACCCGGCTACTCATC	293886
293887	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GATAACTGGTTCGAGGAGTACGAGCGTAATATGGATA	293953
293954	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GGGGGGCGGGCAGCACGGCGGTGATCTGCTTTTCGG	294019
294020	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ACGATCGCCGGCGAGGATCTTACCGGTTACACGGTA	294085
294086	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CGGAATGCTACTTACTATGCGCGCGCATCCTCGC	294149
294150	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GACGTTTATCTTATAGTCGAATTGATTGCTCATTGT	294215
294216	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GAACAAGCTGGTCGTTCAGAATCATTATCACTTT	294279
294280	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CGGTAGCGAAAACTACTTTTTATTTCAGGACAAAGA	294345
294346	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TCTTCATAGAACTGTTGTTTATTAGTGATGATATGTT	294412
294413	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TGAGCTATTTCTTTGTCGTCTTGTCTTGAGACTTG	294477
294478	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TAGAACATACTATTAATAATACATCAAGAACATC	294541
294542	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AATCGGCGCAAAGGACTACGCCGCCGGCAACCACGGC	294608
294609	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTCGCTCCCTTTTTAACCCCGAGCGCGGGCATATT	294673
294674	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT		294703

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_Crispr_6

CRISPR start position : 296084 ---------- CRISPR end position : 300394 ---------- CRISPR length : 4310
DR consensus : GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
DR length : 30 Number of spacers : 65

296084	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA	296149
296150	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA	296215
296216	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA	296281
296282	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA	296347
296348	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TGTCGTAACAGCAGGGATGAACTATGCGCTGCACG	296412
296413	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CGTTATACCTTCTATCGTCTTCAAATCTAAGGAT	296476
296477	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GGGTGGCGAGCAATGACGCGCTCCAGAACCCGACCG	296542
296543	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CCTTTGCCGTACGGGCGCGGCCGTAATGCGATCAAAG	296609
296610	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AATACGTAGGAGGCGGACTATGATAGTAGCGATTAT	296675
296676	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CGTCAGCGCTTCAAGTACTCCACCCGCTCCTACGAG	296741
296742	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTGTAGAATCTTATGTTTTTAGAGAACTATTTAATCA	296808
296809	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ATGAAATAACCCCAAAGATAAATCCAACTACAGGCAAA	296876
296877	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TAAATAATCATTTAATTGTAACATTTTGTGAATA	296940
296941	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ATAGTATCACACAACATCAAATGTTAGATGGATAT	297005
297006	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTAGTAGGAGATGAAGACGACTTTTTTAACGTGGTCAA	297073
297074	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CTTTGTAGATTTATCGGATTATTTCGATATTATAA	297138
297139	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTAATGCAAAAACTATAGTCCTCAACGCTAAAGACGC	297205
297206	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AGTATGCCTGACACGCGAGATCGCACCTTGTCGAGG	297271
297272	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ACGGGCGTTGTTCAGTCGGTCGTTATCGGAGTAATCGA	297339
297340	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ACTATTCGGGAGGGAAGATATACAACGAGACCGAT	297404
297405	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ACGGGGATGGCTCAGCCCTCGATTAGCCGGTTTCTGGC	297472
297473	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CTTGCCTTTAGAGCTCTTTTTTTATCAAGCTCATTG	297538
297539	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GCATTCGCGATTTTTCCGACCTCGAACGAATCGTAT	297604
297605	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GACGCAGGCGCGGGCGGACGTGTATAAAAAGTACT	297669
297670	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTCGGTGGCATCGTCTTCGTTCGCATACAGAACGT	297734
297735	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ATTTCTTACGCCCCATTCAAACTCATCCAGAAATTCT	297801
297802	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TGTTTCAGGATTTACCGTTGTGTACGTTCTGAGCT	297866
297867	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GTGAACGGAGCGTCGAAACAATGCCACGTTCCGAA	297931
297932	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CCGAGCGATAAGACCACATAAGGAGAAACGATCCGCT	297998
297999	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ACCTGCAATAGATATACGACATAATTTCGTATTGCA	298064
298065	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CCTCTAAAATCATGTACGATTTTAGGGGGTTGTTTA	298130
298131	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AGTAATTATTCAAATTTCTTGTTTATCGGATCTCT	298195
298196	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GAGGCCTCATTCGGCTCTATCTTCGCACCCGACAC	298260
298261	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TGTTGGCTTCCAACTTGTCGGCTTTGATCTCAACAT	298326
298327	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CCGACCTGCTTCCACCCTCTTCCGCCTTTATTCAA	298391
298392	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TCTTTTTTTGAAGAAAATTCATAGAAACAATGTAAG	298457
298458	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GCTTTTTCACCTTTCGCGCCAATCGCTCAAAGCTCA	298523
298524	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GCTTTTTCACCTTTCGCGCCAATCGCTCAAAGCTCA	298589
298590	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GTGATACGATTAATACGTTAGCGTTATTCTTCATG	298654
298655	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTCTTTATCGTGATATTTTGTCCGCTCTTTTTGAC	298719
298720	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AGGTTGCGCATTTCTTCTCCATGCAAGATGTAAACA	298785
298786	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTCATGTCTATTCCTCTTCTTTATAGGTTCCTAATTT	298852
298853	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TAAATGCGTTCTCAATCACACCAATCTTGCCGGC	298916
298917	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CGTTCAGTTGTTCGCATTCAGTCGCCGACTGCCCC	298981
298982	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ATCCACATTAGACGCATTCGCACTCGTCCAGCCCG	299046
299047	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CTGATGACATACAAAGAGTATATCGCGGCAATGGT	299111
299112	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TATCCTCGTACAGGTTTGCCACCTTGTCGGAGACGT	299177
299178	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ATGCTTATTCAAAGGTGGATCGCGTGGTGATTTCTCAG	299245
299246	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CCTTCTACGATTACTGCCATTTACTTTACTTTTTTT	299311
299312	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TAATAGTCCACACCCCAACGCCAAAGGATGAATCG	299376
299377	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CGGTAATCCTCCAGCGACGCCAGCCCGTCCGTGGCG	299442
299443	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AACGTCGATGTCTCAGGCGACTATGGCACAGCCACA	299508
299509	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CGACATGCCACCCGCAGGACACGATATGCCGCGAGA	299574
299575	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GCGGCCCTTGTCGGCCGCTCTCTCTTTCGTTATCGA	299640
299641	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GCGTACCCGCCTCTGCAGTTGCAAACACAGCTGCGA	299706
299707	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CCAGCCTTGTTTTTCGAACCCGAGGTGGCAAGGAC	299771
299772	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GTACAGGCGATTACGGGCGTGGTGGGTAAAGAGTTCG	299838
299839	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CCGCGTCGGACAAGTCCGCGGGCTGGAGACCCAGTA	299904
299905	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTTCTCTGACATTAAAATAGAAATCATCGCTGAAGA	299970
299971	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CCTCCGCCCCCAGCCCGCTATCGACCCCCACCTGC	300035
300036	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AGGGCTGACGTGTATAAAAAATACCTGGGGGATAAT	300101
300102	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CTCAACCAGTTCGGGCTGGAGGCGTCGGAGGCGGCT	300167
300168	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ACTTCGCCGTCCGCGGTAATGTGACCAATACCGAC	300232
300233	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CACCCACCCACGCCAGCACCCTCTGCCACCAGCGC	300297
300298	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AACTCAAAAAAACTACAATAAATATGCCAACAGTAGT	300364
300365	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT		300394

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_Crispr_7

CRISPR start position : 604390 ---------- CRISPR end position : 605408 ---------- CRISPR length : 1018
DR consensus : ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC
DR length : 30 Number of spacers : 15

604390	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	AATATGCCCGCGCTCGGGGTTAAAAAGGGAGCGAA	604454
604455	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GCCGTGGTTGCCGGCGGCGTAGTCCTTTGCGCCGATT	604521
604522	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GATGTTCTTGATGTATTATTAATAGTATGTTCTA	604585
604586	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	CAAGTCTCAAGACAAGACGACAAAGAAATAGCTCA	604650
604651	ATTTCAATTGCACCATACAGGAAATTAAAA	CAACATATCATCACTAATAAACAACAGTTCTATGAAGA	604718
604719	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	TCTTTGTCCTGAAATAAAAAGTAGTTTTCGCTACCG	604784
604785	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	AAAGTGATAATGATTCTGAACGACCAGCTTGTTC	604848
604849	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	ACAATGAGCAATCAANTTCGACTATAAGATAAACGTC	604915
604916	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GCGAGGATGCGCGCGCATAGTAAGTAGCATTCCG	604979
604980	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	TACCGTGTAACCGGTAAGATCCTCGCCGGCGATCGT	605045
605046	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	CCGAAAAGCAGATCACCGCCGTGCTGCCCGCCCCCC	605111
605112	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	TATCCATATTACGCTCGTACTCCTCGAACCAGTTATC	605178
605179	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GATGAGTAGCCGGGTAGCTGTCATAGGGGGTACGCC	605244
605245	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	CCTTCGAGGCGCCTGCTTTGTCGTCTGCAGGCTGGAA	605311
605312	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GAGCGATGCAGGCTCGTTGGAAGAGGTCGGTATGCAA	605378
605379	ATTTCAATTGCACCATACAGGAGGTAGTAT		605408

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_Crispr_9

CRISPR start position : 1515077 ---------- CRISPR end position : 1515310 ---------- CRISPR length : 233
DR consensus : GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC
DR length : 36 Number of spacers : 3

1515077	GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC	GATGTGGCTGTAGATGCACTCTTCCGCAAA	1515142
1515143	GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC	GAAGTGGCCAATGTTCGATAGGCTGCTCAG	1515208
1515209	GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC	ACTGCCATATTATATAAGTGTGATTATTTT	1515274
1515275	GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC		1515310

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_1

CRISPR start position : 6623 ---------- CRISPR end position : 6770 ---------- CRISPR length : 147
DR consensus : GAACCAAGGACCCTCTGATTAACAGTCAGATGCTCTAACCAACTGAGCTAAG
DR length : 52 Number of spacers : 1

6623	GAACCAAGGACCCTCTGATTAACAGTCAGATGCTCTAACCAACTGAGCTAAG	GAAGAATAGAAAAACGGCTTATGAGAGCGCTTTCTCTTGGGCTC	6718
6719	GAACCAAGGACCCTCTGATTAACAGTCAGATGCTCTAACCGACTGAGCTAAG		6770

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_2

CRISPR start position : 237463 ---------- CRISPR end position : 237560 ---------- CRISPR length : 97
DR consensus : CTTCGAATCCGTTTATATAAGGCCTAAAAT
DR length : 30 Number of spacers : 1

237463	CTTCGAATCCGTTTATATAAGGCCTAAAAT	ATTACTACGGGAAAGCCCAGCGAACGCATTGCCGGAAT	237530
237531	CTTCGAATCCGTTTATATAAGGCCTAAAAT		237560

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_3

CRISPR start position : 251189 ---------- CRISPR end position : 251297 ---------- CRISPR length : 108
DR consensus : AGGAAGCCGTTGTCACGTGACAATCAC
DR length : 27 Number of spacers : 1

251189	AGGAAGCCGTTGTCACGTGACAATCAC	TCCGTGCATGATGCAGGAAGCCGTTGTCACGTGACAATCACTCCGTGCACGATGC	251270
251271	AGGAAGCCGTCGTCACGTGACAATCAC		251297

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_8

CRISPR start position : 786761 ---------- CRISPR end position : 786869 ---------- CRISPR length : 108
DR consensus : GCCATTGCTTTCATGGCAGCGATTTGAGCCGAGTCGGGGC
DR length : 40 Number of spacers : 1

786761	GCCATTGCTTTCATGGCAGCGATTTGAGCCGAGTCGGGGC	TCTTCCCTCCATTTGCTTTCATCTTTGCC	786829
786830	GCCATTGCTTTCATGGCAGCGATTTGAGCTGAGTCGGGGC		786869

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_10

CRISPR start position : 1871966 ---------- CRISPR end position : 1872073 ---------- CRISPR length : 107
DR consensus : GAAGCGATTTCGGCGAAAAAATTCCT
DR length : 26 Number of spacers : 1

1871966	GAAGCGATTTCGGCGAAAAAATTCCT	TGCTGCAGCTTGCAGGAAGCTACTTTGGCGAAAAAATTCCTATTTGCAGCTTGCAA	1872047
1872048	GAAGCGATTTCGGCAAAAAAATTCCT		1872073

Display spacers	Crispr Properties

259611	GTCTTAATAGCCTTACGGACTGTGTATGTATAGTGAG	CCAAAACTGCTAAGGCTGCAGCTCAGAATGCACTAGACCAGTT	259690
259691	GTCTTAATAGCCTTACGGACTGTGTATGTATAGTGAG	TATAGTTCAAGCTTCTGATACAGACTTGATTGAAGAAGA	259766
259767	GTCTTAATAGCCTTACGGACTGTGTATGTATAGTGAG	CGGGAGTGCGACAAGATACTTGGCTCCGGCCGCACGATTGG	259844
259845	GTCTTAATAGCCTTACGGACTGTGTATGTATAGTGAG	CGTATATCCGGCATTAGTAGGAGAGGTTATGATAA	259916
259917	GTCTTAATAGCCTTACGGACTGTGTATGTATAGTGAG		259953

CRISPRs found in the submitted sequence(s)